Chromas破解版-ChromasDNA序列读图软件 v2.6.5破解版下载
Chromas是一款DNA序列分析读图软件,知识兔使用知识兔这款软件可以帮助知识兔打开ab1、scf、ztr格式的图谱文件,知识兔支持自动删除低质量序列和矢量序列,软件还支持将图谱进行格式转换,知识兔从而方便使用其它软件打开。
使用方法
1、知识兔选择File菜单打开一个序列文件,或者直接通过Open打开。
2、一般测序中一个反应大概能测的长度为800左右,由于荧光染料的干扰和机器性能,测序结果在最开始和最后面的时候有几十个碱基不准确,如下图中红框的部分。评判测序结果的时候可以忽略前50个和后50个碱基。
3、知识兔通过工具栏的缩放工具,知识兔可以放大或者缩小整个视图:
通过上图可以看出,不同碱基对应不同的颜色。
4、通过工具栏的“Find‘工具,知识兔可以查找某个序列:
5、通过“File”菜单栏的Blast Search可以直接连接在线数据库,将序列进行Blast,省去了知识兔打开NCBI等数据库然后知识兔复制序列再比对的麻烦:
知识兔点击OK之后出现如下界面,然后知识兔知识兔点击“View report”即可。
6、Chromas还自带序列翻译蛋白质功能,知识兔点击“Options-》Show Translations-》All”显示三条蛋白质翻译序列。这里之所以显示三条,是因为Chromas不知道你的序列翻译的起始位点,所以如果知识兔你的序列是cDNA序列,那么这三条蛋白质序列中总有一条是你想要的,这在知识兔做蛋白质点突变的时候非常有用。当然如果知识兔你的是启动子等其他序列,这个功能是多余的。
7、知识兔可以将序列导出,并且知识兔可以设置导出的间隔、分行、以及是否显示序号,下面的设置中代表每60个碱基一行。
8、当然可能会有同学想说,如果知识兔我想把测序峰图放在文章中,我该怎么弄?Chromas没有存储为图片的选项,这时可能有同学就想用截图了,这里Chromas可以存储为PDF格式,在“File”里面选择Print 预览,然后知识兔选择PDF即可。
导出来之后就得到PDF格式的峰图了,这是矢量图,知识兔可以无限放大。然后知识兔通过Photoshop做出所需要的图片。
功能
1、从Applied Biosystems DNA测序仪打开.ab1色谱图文件。
2、开启由别的序列产生器建立或从数据库查询查找的SCF和ZTR格式色谱图文档。
3、储存为.scf或AppliedBiosystems.ab1格式。
4、打印出色谱图,在其中包括放缩或合适一页的选择项。
5、全自动删掉低品质序列(当品质数据信息可以用时)或矢量素材序列。
6、以纯文字,FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank或??GCG格式导出来序列,或应用基本上序号格式化以开展演试。
7、知识兔将序列以纯文字,FASTA或FASTQ格式拷贝到剪贴板,知识兔以黏贴到别的应用软件中。
8、翻转和填补序列和色谱图。
9、知识兔根据精准配对或最好两端对齐检索子序列。
10、表明3帧中的汉语翻译及其序列。
11、拷贝色谱图一部分的图象以黏贴到文本文档或幻灯片中。
12、批处理命令,包含格式变换,带矢量素材删掉的序列导出来,批量打印和原始记录的批量导出。
13、应用NucleicsPtyLtd的PeakTraceRP部件提高.ab1文档,知识兔以提升最高值易读性并获取大量高品质的基本。
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