mega下载_MEGA进化树v7.7.26 绿色中文版下载

软件下载 5 月 16, 2023 0 king

MEGA进化树是一款分子进化遗传分析软件，知识兔用于进行分析遗传学方面的研究，知识兔使用mega可以进行序列对比、进化树的推断、估计分子进化速度、验证进化假说等操作，知识兔还支持通过NCBI进行序列的比对和数据的搜索，是一款简单好用的软件，就算你是新手使用起来也没什么难度！

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mega 使用教程

1、打开mega准备需要建树的序列，并将序列保存为fasta格式。
2、知识兔点击Align–Edit/built Alignment，知识兔选择Create a new alignment，知识兔点击ok。
3、打开fasta序列。
4、知识兔点击Alignment –Align by ClustalW ，知识兔选择所有序列，参数根据需求修改，知识兔选择【默认】，知识兔点击ok。
5、比对完成后，知识兔点击Data –Phylogenetic Analysis，出现坐标箭头指向的两个按钮。
6、知识兔点击Phylogeny，有5个构建进化树的方法，一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、Neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)方法，在此选择选择Neighbor-Joining(邻接法)建树。
7、在Test of Phylogeny 选择Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择Poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 选择Compeledeletion, 知识兔点击Compute得到下面结果，知识兔根据自己的需求对树进行修饰。