Schrodinger Suites2023破解版下载|Schrodinger Suite 2023.2 x64激活教程

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Schrodinger Suites 2017免费下载-1

新功能介绍

一、Maestro图形界面

1、使用Ligand Designer [2020-3]快速轻松地执行手动或引导导线优化

·通过自动预测蛋白质-配体的复杂几何形状来“设计方式”

二维白板式设计

没有蛋白质的3D设计配体

通过简单的蛋白质相互作用视图设计3D配体

蛋白质全3D设计

·叠加信息对设计至关重要

查看可用于配体生长的结合袋区域

查看蛋白质配体相互作用,知识兔包括冲突

查看蛋白质和配体表面

查看由WaterMap确定的可替换和可置换水位

识别适合普通药物化学反应的配体键

·引导式工作流程可加快设计速度

生物甾体替代

等排扫描

更换或置换水位

形成其他蛋白质-配体相互作用

环化配体

杂交配体(合并R-基团)

文件中的码头配体

·使用自定义的R-group库和属性过滤器为您的项目量身定制化学

·通过基于属性的雷达图(MW,logP,HBA,HBD,PSA)快速评估分子的适用性。从PT添加用户属性。

·发送喜爱的设计,知识兔以便通过与FEP +的相似性进行等级排序,在LiveDesign中进行后处理和发布,或者发送到Excel

·窥镜全息显示器的渲染性能更快[2020-3]

设定影片

·调整2D叠加层的大小[2020-3]

·允许在蛋白质膜界面选择残基[2020-3]

·3D Builder:从序列中构建DNA和RNA链[2020-3]

二、多序列查看器

现代化设计,新代码,新功能

·从Maestro的主“窗口”菜单或“任务”菜单中快速访问MSV。通过直观,易于导航的界面改善了用户体验,该界面的设计类似于Maestro 11 [2020-3]

支持序列比对和比较,知识兔以及用于设置比对方法和调整参数的选项[2020-3]

执行成对序列比对

执行多序列比对

生成成对比较矩阵:根据相似性,同一性或保守性比较整个序列或选定的列

·分层显示各种来源的信息,知识兔以增强对序列之间差异或相似性的解释[2020-3]

引入全局注释

按属性应用着色

查看属性指标

快速准确地注释抗体CDR环

可以计算丰富的内置序列描述符,并将值显示在序列旁边的指标列中。

通过这些属性可以灵活地上传用户生成的描述符和颜色序列。

·同源性建模:带有复选标记的指导性逐步结构预测工作流,指示已完成的步骤[2020-3]

查找同系物(BLAST)

支持多种类型的模型

简单模型:一个目标,一个模板

嵌合模型:一个目标,多个模板

批处理模型:多个目标,一个模板

多链模型:同聚和异聚

·在工作区中与3D结构的平滑集成[2020-3]

轻松链接和取消链接序列到结构

根据整个序列比对或结合位点比对比对结构

一键式切换拆分和组合链表示形式

按结构性质的颜色顺序

将序列颜色应用于工作空间结构,反之亦然

三、OPLS3e力场

默认情况下使用的Schrodinger-ANI选项可加快拟合速度,可通过FFB GUI [2020-3]获得

四、FEP +

1、FEP +小组[2020-3]

集成ForceField Builder + FEP工作流程

使用QuickView循环浏览边的贴图/热点区域数据

能够清除所有/选定的实验数据

UX改进以显示Core SMARTS

消除冗余的SMARTS模式

突出显示与核心SMARTS匹配的节点

GUI支持更改Lambda窗口数

2、ABFEP小组[2020-3]

支持多配体输入

Web服务支持

五、分子动力学

卸下Desmond CPU [2020-3]

六、混合溶剂MD(MxMD)

包括与每个热点匹配的探针结构[2020-3]

七、共价配体对接

在优化步骤[2020-3]中应用用户定义的约束

支持原子名称中包含’的附着原子(即核酸)[2020-3]

八、配体对接

结合使用机器学习和Glide对接测试版,将Active Learning Glide应用于数十亿个化合物的超大型图书馆的对接[2020-3]

九、宏周期

(可选)通过输入文件为宏环化脚本提供输入[2020-3]

生成融合蛋白肽接头设计,ADC接头以及具有能力连接断开分子的融合二聚体配体(仅命令行)[2020-3]

十、诱导对接

IFD-MD速度提高了约5倍,而不会影响精度[2020-3]

十一、药理模型

简化create_hypoConsensus脚本的应用程序,该脚本现在可以读取* .phypo格式[2020-3]

十二、配体对准

通过允许参考配体进行搜索来改进参考配体的规格[2020-3]

修复了多个错误(例如,回溯,作业启动失败)[2020-3]

基于flex_align的作业生成的默认遵循者的默认数量较少,知识兔以加快计算速度[2020-3]

添加工具提示[2020-3]

澄清高级选项规范[2020-3]

十三、枚举

通过包含描述和名称来改进名称的反应搜索[2020-3]

十四、化学信息学

通过Canvas指纹或属性创建和应用Kohonen自组织地图-测试版[2020-3]

创建并应用单独的分类和连续QSAR模型,完全控制所应用的功能和机器学习-beta [2020-3]

使用kPLS,MLR,PCR,Bayes或递归分区机器学习技术创建并做出预测

使用各种Canvas指纹,原子和分子描述符或用户提供的描述符来创建机器学习模型

可视化来自kPLS模型预测的原子贡献

自动或手动创建测试/训练集拆分

十五、基于经验和基于质量管理的pKa预测

允许在Jaguar pKa中进行常规和自定义的OPLS3e力场进行构象搜索[2020-3]

十六、QM / MM(QSite)

QSite现在支持OPLS3e力场[2020-3]

十七、量子力学

莫斯鲍尔光谱[2020-3]

在将VCD光谱与Spectrum_align.py [2020-3]对准时,知识兔可以选择使用鲁棒峰

计算在一定压力范围内的热化学性质[2020-3]

环链互变异构体现在可以在AutoConf.py工作流程中生成并评分[2020-3]

.cosmo文件用于COSMO-RS计算[2020-3]

从命令行启动的批处理计算现在可以选择输出并分组失败的子作业,知识兔以简化其进一步处理[2020-3]

十八、结合位点表征

通过新的激酶_conservation_analysis.py脚本执行激酶结合位点残基保守性分析[2020-3]

返回独特的残基对,可优化小分子的选择性

原子水平特性标注了在整个基因家族中最独特的残基对

十九、蛋白质同源性建模

从命令行[2020-3]支持增强对所有Prime优化作业(循环预测,侧链预测,结合位点优化等)中的最小化参数的控制

二十、低温电磁

使用PHENIX / OPLS3e自动进行约束权重扫描,知识兔以确定理想权重[2020-3]

PHENIX / OPLS3e-改进稳定性,知识兔支持多coformer,知识兔支持编写PDB文件[2020-3]

二十一、工作流程和流水线

1、支持最新版本的KNIME(v4.2,但包括v4.1.3)[2020-3]

2、作为LiveDesign模型节点上传[2020-3]

将任何LiveReport列作为输入的通用协议

可以将药理学假说添加到LiveReport中

在计算模型下的指定文件夹中创建模型

协议和模型可以通过python脚本上传

避免KNIME版本不兼容的选项

3、滑行配体对接节点中可以使用任何命令行选项[2020-3]

安装激活教程

1、在知识兔下载并解压,如图所示

药物研发套件Schrodinger Suites 2023-3 x64 免费完整激活版下载-1

2、安装软件,知识兔双击setup.exe运行安装程序,知识兔选择软件安装位置

药物研发套件Schrodinger Suites 2023-3 x64 免费完整激活版下载-2

3、知识兔选择要安装的产品,知识兔点击start开始安装,安装完成,退出向导。将破解文件夹复制到安装目录中,知识兔点击替换目标中的文件,默认路径C:\Program Files\Schrodinger2023-

 

下载仅供下载体验和测试学习,不得商用和正当使用。

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