引物设计软件oligo 7破解版 v7.56下载(附使用教程)

oligo7破解版通过专用的注册机,注册破解好的一款引物设计软件,它的主要功能就是设计和分析序列和PCR引物,合成基因和各种探针,知识兔包括小分子干扰核苷酸和分子信标的工具。它分为三种图,分别为Frq图、Tm图和ΔG图,能够更好的帮助初学者进行软件的使用和学习。另外该如软件还具备基于最近邻热力学数据,低聚糖的搜索算法寻找最佳引物PCR,知识兔包括TaqMan、高度多路复用,共识或简并引物,知识兔支持多个文件的批处理,非常适合使用与生物和化学中。知识兔分享下载,内附有注册机,在下文附有软件的安装破解教程,需要的朋友欢迎前来下载!
oligo7破解版

破解教程

安装前注意:在安装之前必须要先确认电脑上是否安装了java运行环境,若没有安装,请安装一个,推荐安装:JRE 9
1、在知识兔下载好软件包,你会得到如下图所示的几个文件,知识兔双击运行主应用程序。
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2、知识兔根据软件的安装指导完成软件的安装。
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3、软件安装完成后,知识兔双击桌面上的快捷方式打开软件。
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4、打开软件后,在如阿健界面找到“Workstation Code”信息,如下图所示的位置。
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5、打开软件包里面的“keygen”文件下面的“Keygen.exe”注册机,将上一步的Workstation Code”信息复制到注册机中,然后知识兔知识兔点击“Generate”,会生成一串激活码。
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6、再将“Access Code”后面的激活码复制到软件中的“Access Code:”文本框中。
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7、然后知识兔知识兔点击“Confirm Code”即可破解完成
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使用教程

1、首先,同Oligo 6 一样,File菜单下,知识兔选择New sequence ,打开窗口将目的序列粘贴进来,或是选择Open定位到目的cDNA序列(在primer中,该序列已经被保存为Seq文件),这是最初打开时的界面:
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2、然后知识兔就是进行引物的设计了。Search 菜单下,知识兔选择for primes &probes ,即出现引物搜寻窗口:
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3、知识兔根据自己的实际情况选择Parameters 或Ranges设置引物的相关参数和范围。然后知识兔选择Search即开始进行引物的搜索,之后会出现软件所列出的依据得分(Score)高低排列设计的引物。 
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4、知识兔双击每一行所列出的引物会弹出该对引物的具体信息,知识兔以及软件对该对引物的相关评价。
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5、知识兔双击之后在最初的Sequence 窗口中就会出现下面的窗口:  
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6、知识兔点击绿色方形图标前面的i标志可了解对应的具体信息。
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7、之后便是对该引物的具体分析了,这部分的分析同Oligo 6基本上是一样的。选择Analyze菜单,如下图:
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(1)Analyze中,第一项为Key info,知识兔点击Selected primers,会给出两条引物的概括性信息,其中包括引物的Tm值,此时软件是采用nearest neighbor method计算,会比Primer5中引物的Tm值略高,此窗口中还给出引物的Delta G和3’端的Delta G.3’端的Delta G过高,会在错配位点形成双链结构并引起DNA聚合反应,因此此项绝对值应该小一些,最好不要超过9。
(2)Analyze中第二项为Duplex Formation,即二聚体形成分析,知识兔可以选择上游引物或下游引物,分析上游引物间二聚体形成情况和下游引物间的二聚体情况,还可以选择Upper/Lower ,即上下游引物之间的二聚体形成情况。引物二聚体是影响PCR反应异常的重要因素,因此应该避免设计的引物存在二聚体,至少也要使设计的引物形成的二聚体是不稳定的,即其Delta G值应该偏低,一般不要使其超过4.5kcal/mol,结合碱基对不要超过3个。Oligo此项的分析窗口中分别给出了3’端和整个引物的二聚体图示和Delta G值。
(3)Analyze中第三项为Hairpin Formation,即发夹结构分析。知识兔可以选择上游或者下游引物,同样,Delta G值不要超过4.5kcal/mol,碱基对不要超过3个。
(4)Analyze中第四项为Composition and Tm,会给出上游引物、下游引物和产物的各个碱基的组成比例和Tm值。上下游引物的GC%需要控制在40%~60%,而且知识兔上下游引物之间的GC% 不要相差太大。Tm值共有3个,分别采用三种方法计算出来,知识兔包括nearest neighbor method、%GC method和2(A+T)+4(G+C)method,最后一种应该是Primer5所采用的方法,Tm 值可以控制在50~70度之间。
(5)第五项为False Priming Sites,即错误引发位点,在Primer5中虽然也有False priming分析,但不如oligo详细,并且知识兔oligo会给我正确引发效率和错误引发效率,一般的原则要使误引发效率在100以下,当然有时候正确位点的引发效率很高的话,比如达到400~500,错误引发效率超过100幅度若不大的话,知识兔也可以接受。
(6)Analyze中,有参考价值的最后一项是“PCR”,在此窗口中,是基于此对引物的PCR反应Summary,并且知识兔给出了此反应的最佳退火温度,另外,分享了对于此对引物的简短评价。若该引物有不利于PCR反应的二级结构存在,并且知识兔Delta G值偏大的话,在最后的评价中会注明,若没有注明此项,表明二级结构能值较小,基本可以接受。
(7)另外,Internal stability也很重要,最好是中间高两边低的弧形。
引物设计软件oligo 7破解版 v7.56下载(附使用教程)

功能介绍

1、分析TM和内部稳定性,绘制溶解温度图和稳定性图
2、给出寡核苷酸的重要相关信息
3、显示正向引物、反向引物和当前的OLIGO里潜在的连接物,潜在的二聚物也可显示出来
4、分析显示在选中的正向引物或反向引物中基本的成份和溶解温度
5、精确地分析出生物信息软件中的错配位点
6、正向引物和反向引物选中后,能自动产生PCR实验条件和PCR产物信息

软件特色

1、使用方面还是比较的灵活
2、操作的话也得到了大家的任何
3、功能方面也比较的全面
4、虽然是英文的操作界面,也不会影响用户进行使用>

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