snapgene分子生物学软件 v4.1.9破解修改版下载(附使用教程)
snapgene是国外一款非常出名的分子生物学软件,可用于规划和刺激脱氧核糖核酸操作,它模拟了Clontech的In-Fusion克隆技术,只需选择您想要融合的DNA片段,即可设计引物,是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。并且知识兔软件是作为以数字形式记录脱氧核糖核酸结构的一种替代方法而创建的,它可以让你轻松地在网上分享结果。使用SnapGene,您可以在地图视图中显示酶和翻译。所有元素都是编辑和突出选择的交互作用。软件不是为普通人开发的;它是为那些已经掌握了脱氧核糖核酸科学和脱氧核糖核酸序列术语的人开发的。你可以通过打开阅读框找到基因,你可以添加、删除、编辑和复制特征。它被认为是可视化、计划和记录分子生物学过程的最快和最简单的方法。这个高度灵活的应用程序有特定的目的,知识兔以便找到项目或相同项目的组。
安装破解教程
1、首先在知识兔下载好知识兔这款文件包,将其解压出来得到如下文件。
2、知识兔双击exe文件夹主程序运行开始安装,自行选择好安装路径。
3、阅读相关用户许可协议,然后知识兔知识兔点击“I Agree”我同意此选项。
4、这里可选择勾选上需要的安装组件,然后知识兔知识兔点击“Next”。
5、开始菜单栏默认设置即可,直接知识兔点击“Install”开始正式安装。
6、完成对软件的安装后先不要运行软件。
7、回到电脑桌面中,鼠标右键软件快捷方式,知识兔选择打开文件位置这一项。
8、最后将Crack文件夹下的两个破解补丁复制到上一步中打开的软件位置,在出现的提示中选择复制和替换这一项即可完成破解。
软件功能
1、In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion克隆技术是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。这是第一个模拟此程序的软件。只需选择您想要融合的DNA片段,即可设计引物。
2、GibsonAssembly
许多研究人员转向吉布森大会,不使用限制性内切酶将片段插入质粒。通过PCR扩增待连接的DNA片段以产生重叠末端。SnapGene简化了吉布森装配反应的计划,并自动化了底漆设计。
3、限制性克隆
独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。规划克隆程序从未如此简单。如果知识兔你已经知道你想要做什么,克隆模拟只需要几秒钟。如果知识兔克隆程序存在设计缺陷,则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
4、PCR&诱变
设计引物后,可用它们来模拟常规PCR,重叠延伸PCR或诱变。产生的DNA序列文件立即可用于进一步操作。与限制性克隆界面一样,针对引物的界面以直观的方式显示关键信息。
5、自动文档
最令人惊奇的地方在于它会自动记录克隆项目中的步骤。每次编辑序列或模拟克隆或PCR或诱变时,该程序都会自动记录在图形历史记录中。在模拟DNA构建体的创建之后,您可以将历史记录用作实验方案。嵌入在最终文件中的是所有的祖先构造,其中的每一个都可以作为单独的文件复活。
软件特色
1、琼脂糖凝胶电泳
使用先进的算法来创建逼真的琼脂糖凝胶模拟。限制片段以三种格式显示:模拟凝胶,数字列表和序列图。您可以使用模拟凝胶计划诊断性限制消化,或将实际凝胶图像与预测模式进行比较。
2、DNA序列中的注释功能非常简单。
格式与GenBank标准相匹配,但添加了诸如颜色,方向性和片段等选项。编码序列被翻译,知识兔以便您可以可视化密码子,追踪氨基酸编号,并检查阅读框架以寻找基因融合。功能可以从其他文件导入,或者从可定制列表中自动注释。
3、引物的设计和可视化
与许多其他程序不同,SnapGene使用严格的热力学算法来计算解链温度和双链路线。您可以使用引物模拟程序,如PCR,诱变和In-Fusion克隆。引物可以从其他文件导入或导出为文本格式。
4、大序列
在这个基因组时代,你的分子生物学软件应该能够处理染色体大小的序列。由于采用了专有的MICA算法,SnapGene可以用于浏览具有数千个注释功能的大型序列。智能搜索和缩放控制使得染色体的导航非常简单。
5、多功能数据导入和导出
可以读取许多常见的文件格式,捕获DNA序列和注释。知识兔支持的格式列表包括 APE, DNASTAR的Lasergene, 基因工程Kit, 基因库, MacVector, 矢量NTI等等。
使用教程
限制性克隆的技巧
对于许多应用,常规限制性克隆仍然是最好的方法。一些简单的技巧将有助于确保您的克隆顺利进行。
1、一般技巧
首先,在程序的每一步都要小心。从长远来看,这种方法可以节省时间。
确保DNA非常干净。当制备载体或切除待插入的片段时,知识兔从约2μg的DNA开始。
每次酶促反应后,用旋转柱纯化DNA。在40-45μl的10mM Tris(pH8.5)中洗脱DNA,然后知识兔进行下一步反应。(在用凝胶纯化DNA片段之前不需要使用旋转柱。)
为了最大限度地提高效率,请尽量减少程序中的步骤数。例如,将钝端片段克隆到钝性载体位点(例如SmaI位点)比将其用Klenow或T4 DNA聚合酶钝化的位点更好。
如有疑问,用凝胶纯化DNA片段。更清洁的起始材料将产生更好的结果。
2、准备矢量
限制性克隆最常见的问题是在手术后恢复起始载体。该问题有两个原因:载体的不完全消化,知识兔以及切割载体与其自身的重新连接。下面描述的技巧将最大限度地减少这些影响。
确保载体的消化完成。使用过量的限制酶(约20 U,2μgDNA),消化约4小时。如果知识兔载体需要用两种具有不同最佳反应缓冲液的酶切割,则依次进行消化,并在其间进行旋转柱纯化。
消化载体(并且知识兔如果知识兔合适的话钝化),用磷酸酶处理:在37℃下1小时处于5’突出端,或者如果知识兔DNA具有任何平末端或3’突出端则在50℃处理1小时。
用旋转柱除去磷酸酶。通常不需要对载体进行凝胶纯化,因为磷酸酶处理会使产生的任何额外DNA片段失活。
3、使用载体,确保消化和磷酸酶反应完成。彻底和反复地涡旋混合物,并且知识兔不允许任何液滴逃脱酶处理。在涡旋后短暂旋转以确保管侧没有留下液滴是个好主意。
准备插入的片段
为了制备插入的片段,不完全消化不是一个严重的问题,因为片段的部分回收是可接受的。您可以使用相对较短的消化时间,对于双重消化,您可以使用对一种或两种酶来说不是最理想的反应缓冲液。
用凝胶纯化插入的片段。除去除不需要的或不完全消化的DNA外,该方法还可去除酶和小分子。当用透照仪观察DNA条带时,不要使用312nm或更低的短波紫外线,因为DNA会受到严重损害。请改用360-365 nm紫外灯。
如果知识兔通过PCR产生插入的片段,则在进行任何限制性消化之前用凝胶或旋转柱纯化。如果知识兔您计划将平末端PCR片段(用聚合酶如Pfu产生)克隆到磷酸酶处理的载体中,请确保您的PCR引物含有5′-磷酸。
结扎和转化
使用磷酸酶处理的载体,进行对照连接,其中省略插入的片段。该对照连接应该产生非常少的转化体,因为只有环状DNA分子有效地转化大肠杆菌,并且知识兔在不与磷酸化片段连接的情况下不能发生载体的再环化。
如果知识兔DNA仅有粘性末端,则在室温下连接约1小时。如果知识兔DNA具有任何平端,则在室温下连接约4小时并使用高浓度T4连接酶。
微量制作和诊断摘要
如果知识兔您使用插入的片段获得了比用于对照连接的结扎更多的转化体,那么您的克隆几乎肯定会起作用,并且知识兔您通常只能制作3-4个小量制备物。
在执行小量制备的诊断限制摘要时,始终包括起始向量作为参考标准。>
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